Protein–RNA interactions for Protein: Q8VED5

Krt79, Keratin, type II cytoskeletal 79, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt79Q8VED5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt79Q8VED5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt79Q8VED5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt79Q8VED5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt79Q8VED5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt79Q8VED5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt79Q8VED5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt79Q8VED5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt79Q8VED5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt79Q8VED5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt79Q8VED5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt79Q8VED5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Krt79Q8VED5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt79Q8VED5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt79Q8VED5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt79Q8VED5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt79Q8VED5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt79Q8VED5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt79Q8VED5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt79Q8VED5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt79Q8VED5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt79Q8VED5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt79Q8VED5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt79Q8VED5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt79Q8VED5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt79Q8VED5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms