Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1B8

Rorb, Nuclear receptor ROR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorbQ8R1B8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RorbQ8R1B8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RorbQ8R1B8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RorbQ8R1B8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RorbQ8R1B8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RorbQ8R1B8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RorbQ8R1B8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RorbQ8R1B8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RorbQ8R1B8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RorbQ8R1B8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RorbQ8R1B8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RorbQ8R1B8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RorbQ8R1B8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RorbQ8R1B8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RorbQ8R1B8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RorbQ8R1B8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RorbQ8R1B8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RorbQ8R1B8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RorbQ8R1B8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RorbQ8R1B8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RorbQ8R1B8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RorbQ8R1B8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RorbQ8R1B8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RorbQ8R1B8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RorbQ8R1B8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RorbQ8R1B8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RorbQ8R1B8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RorbQ8R1B8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RorbQ8R1B8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RorbQ8R1B8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RorbQ8R1B8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RorbQ8R1B8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RorbQ8R1B8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RorbQ8R1B8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RorbQ8R1B8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RorbQ8R1B8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RorbQ8R1B8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RorbQ8R1B8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RorbQ8R1B8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RorbQ8R1B8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RorbQ8R1B8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RorbQ8R1B8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RorbQ8R1B8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RorbQ8R1B8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RorbQ8R1B8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RorbQ8R1B8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RorbQ8R1B8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RorbQ8R1B8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RorbQ8R1B8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RorbQ8R1B8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RorbQ8R1B8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RorbQ8R1B8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RorbQ8R1B8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RorbQ8R1B8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RorbQ8R1B8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RorbQ8R1B8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RorbQ8R1B8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RorbQ8R1B8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RorbQ8R1B8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RorbQ8R1B8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RorbQ8R1B8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RorbQ8R1B8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RorbQ8R1B8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RorbQ8R1B8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RorbQ8R1B8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RorbQ8R1B8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RorbQ8R1B8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RorbQ8R1B8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RorbQ8R1B8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RorbQ8R1B8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RorbQ8R1B8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RorbQ8R1B8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RorbQ8R1B8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RorbQ8R1B8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RorbQ8R1B8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RorbQ8R1B8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RorbQ8R1B8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RorbQ8R1B8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RorbQ8R1B8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RorbQ8R1B8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RorbQ8R1B8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RorbQ8R1B8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RorbQ8R1B8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RorbQ8R1B8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RorbQ8R1B8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RorbQ8R1B8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RorbQ8R1B8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RorbQ8R1B8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RorbQ8R1B8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RorbQ8R1B8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RorbQ8R1B8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RorbQ8R1B8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RorbQ8R1B8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RorbQ8R1B8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RorbQ8R1B8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RorbQ8R1B8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RorbQ8R1B8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RorbQ8R1B8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RorbQ8R1B8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RorbQ8R1B8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms