Protein–RNA interactions for Protein: Q8K168

1700001C19Rik, RIKEN cDNA 1700001C19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700001C19RikQ8K168 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
1700001C19RikQ8K168 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700001C19RikQ8K168 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms