Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms