Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD19

Lancl3, LanC-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl3Q8CD19 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lancl3Q8CD19 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lancl3Q8CD19 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lancl3Q8CD19 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lancl3Q8CD19 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lancl3Q8CD19 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lancl3Q8CD19 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lancl3Q8CD19 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lancl3Q8CD19 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lancl3Q8CD19 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Lancl3Q8CD19 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20■□□□□ 0.79
Lancl3Q8CD19 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lancl3Q8CD19 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Lancl3Q8CD19 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lancl3Q8CD19 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Lancl3Q8CD19 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Lancl3Q8CD19 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Lancl3Q8CD19 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lancl3Q8CD19 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Lancl3Q8CD19 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lancl3Q8CD19 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lancl3Q8CD19 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lancl3Q8CD19 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lancl3Q8CD19 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lancl3Q8CD19 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lancl3Q8CD19 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lancl3Q8CD19 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lancl3Q8CD19 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lancl3Q8CD19 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lancl3Q8CD19 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lancl3Q8CD19 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lancl3Q8CD19 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lancl3Q8CD19 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lancl3Q8CD19 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lancl3Q8CD19 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lancl3Q8CD19 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lancl3Q8CD19 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lancl3Q8CD19 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lancl3Q8CD19 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lancl3Q8CD19 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lancl3Q8CD19 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lancl3Q8CD19 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lancl3Q8CD19 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lancl3Q8CD19 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lancl3Q8CD19 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lancl3Q8CD19 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lancl3Q8CD19 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lancl3Q8CD19 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lancl3Q8CD19 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lancl3Q8CD19 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Lancl3Q8CD19 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lancl3Q8CD19 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lancl3Q8CD19 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lancl3Q8CD19 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lancl3Q8CD19 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lancl3Q8CD19 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Lancl3Q8CD19 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lancl3Q8CD19 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lancl3Q8CD19 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lancl3Q8CD19 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lancl3Q8CD19 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lancl3Q8CD19 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lancl3Q8CD19 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lancl3Q8CD19 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lancl3Q8CD19 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lancl3Q8CD19 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lancl3Q8CD19 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lancl3Q8CD19 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Lancl3Q8CD19 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lancl3Q8CD19 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lancl3Q8CD19 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lancl3Q8CD19 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lancl3Q8CD19 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lancl3Q8CD19 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lancl3Q8CD19 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lancl3Q8CD19 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lancl3Q8CD19 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Lancl3Q8CD19 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lancl3Q8CD19 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lancl3Q8CD19 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lancl3Q8CD19 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Lancl3Q8CD19 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lancl3Q8CD19 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lancl3Q8CD19 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lancl3Q8CD19 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lancl3Q8CD19 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lancl3Q8CD19 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lancl3Q8CD19 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lancl3Q8CD19 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms