Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9M2

Ccdc15, Coiled-coil domain-containing protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc15Q8C9M2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc15Q8C9M2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc15Q8C9M2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms