Protein–RNA interactions for Protein: Q8C963

Ccdc159, Coiled-coil domain-containing protein 159, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc159Q8C963 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc159Q8C963 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc159Q8C963 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc159Q8C963 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc159Q8C963 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc159Q8C963 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc159Q8C963 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc159Q8C963 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc159Q8C963 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc159Q8C963 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc159Q8C963 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc159Q8C963 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc159Q8C963 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc159Q8C963 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc159Q8C963 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc159Q8C963 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc159Q8C963 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc159Q8C963 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc159Q8C963 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc159Q8C963 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc159Q8C963 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc159Q8C963 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc159Q8C963 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc159Q8C963 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc159Q8C963 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc159Q8C963 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc159Q8C963 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc159Q8C963 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc159Q8C963 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc159Q8C963 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc159Q8C963 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc159Q8C963 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc159Q8C963 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc159Q8C963 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc159Q8C963 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc159Q8C963 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc159Q8C963 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc159Q8C963 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc159Q8C963 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc159Q8C963 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc159Q8C963 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc159Q8C963 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc159Q8C963 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc159Q8C963 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc159Q8C963 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc159Q8C963 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc159Q8C963 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc159Q8C963 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc159Q8C963 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc159Q8C963 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc159Q8C963 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc159Q8C963 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc159Q8C963 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc159Q8C963 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc159Q8C963 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc159Q8C963 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc159Q8C963 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc159Q8C963 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc159Q8C963 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc159Q8C963 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc159Q8C963 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc159Q8C963 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc159Q8C963 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc159Q8C963 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc159Q8C963 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc159Q8C963 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc159Q8C963 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc159Q8C963 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc159Q8C963 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc159Q8C963 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc159Q8C963 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc159Q8C963 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc159Q8C963 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc159Q8C963 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc159Q8C963 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc159Q8C963 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc159Q8C963 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc159Q8C963 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc159Q8C963 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc159Q8C963 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc159Q8C963 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc159Q8C963 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc159Q8C963 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc159Q8C963 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc159Q8C963 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc159Q8C963 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc159Q8C963 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc159Q8C963 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc159Q8C963 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc159Q8C963 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc159Q8C963 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc159Q8C963 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc159Q8C963 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc159Q8C963 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc159Q8C963 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc159Q8C963 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc159Q8C963 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc159Q8C963 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc159Q8C963 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc159Q8C963 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90 ms