Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8B0

Alx1, ALX homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx1Q8C8B0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Alx1Q8C8B0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Alx1Q8C8B0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Alx1Q8C8B0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Alx1Q8C8B0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Alx1Q8C8B0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Alx1Q8C8B0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Alx1Q8C8B0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Alx1Q8C8B0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Alx1Q8C8B0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Alx1Q8C8B0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Alx1Q8C8B0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Alx1Q8C8B0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Alx1Q8C8B0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Alx1Q8C8B0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Alx1Q8C8B0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Alx1Q8C8B0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Alx1Q8C8B0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Alx1Q8C8B0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Alx1Q8C8B0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Alx1Q8C8B0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Alx1Q8C8B0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Alx1Q8C8B0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Alx1Q8C8B0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Alx1Q8C8B0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Alx1Q8C8B0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Alx1Q8C8B0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Alx1Q8C8B0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Alx1Q8C8B0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Alx1Q8C8B0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Alx1Q8C8B0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Alx1Q8C8B0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Alx1Q8C8B0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Alx1Q8C8B0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Alx1Q8C8B0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Alx1Q8C8B0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Alx1Q8C8B0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Alx1Q8C8B0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Alx1Q8C8B0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Alx1Q8C8B0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Alx1Q8C8B0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Alx1Q8C8B0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Alx1Q8C8B0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Alx1Q8C8B0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Alx1Q8C8B0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Alx1Q8C8B0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Alx1Q8C8B0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Alx1Q8C8B0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Alx1Q8C8B0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Alx1Q8C8B0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Alx1Q8C8B0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Alx1Q8C8B0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Alx1Q8C8B0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Alx1Q8C8B0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Alx1Q8C8B0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Alx1Q8C8B0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Alx1Q8C8B0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Alx1Q8C8B0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Alx1Q8C8B0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Alx1Q8C8B0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Alx1Q8C8B0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Alx1Q8C8B0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Alx1Q8C8B0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Alx1Q8C8B0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Alx1Q8C8B0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Alx1Q8C8B0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Alx1Q8C8B0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Alx1Q8C8B0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Alx1Q8C8B0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Alx1Q8C8B0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Alx1Q8C8B0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Alx1Q8C8B0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Alx1Q8C8B0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Alx1Q8C8B0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Alx1Q8C8B0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Alx1Q8C8B0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Alx1Q8C8B0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Alx1Q8C8B0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Alx1Q8C8B0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Alx1Q8C8B0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Alx1Q8C8B0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Alx1Q8C8B0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Alx1Q8C8B0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Alx1Q8C8B0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Alx1Q8C8B0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Alx1Q8C8B0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Alx1Q8C8B0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Alx1Q8C8B0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Alx1Q8C8B0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Alx1Q8C8B0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Alx1Q8C8B0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Alx1Q8C8B0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Alx1Q8C8B0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Alx1Q8C8B0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Alx1Q8C8B0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Alx1Q8C8B0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Alx1Q8C8B0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Alx1Q8C8B0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Alx1Q8C8B0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Alx1Q8C8B0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms