Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Grik4Q8BMF5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grik4Q8BMF5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grik4Q8BMF5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grik4Q8BMF5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grik4Q8BMF5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grik4Q8BMF5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grik4Q8BMF5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grik4Q8BMF5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grik4Q8BMF5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grik4Q8BMF5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grik4Q8BMF5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grik4Q8BMF5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grik4Q8BMF5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grik4Q8BMF5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grik4Q8BMF5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Grik4Q8BMF5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grik4Q8BMF5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grik4Q8BMF5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grik4Q8BMF5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grik4Q8BMF5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grik4Q8BMF5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grik4Q8BMF5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grik4Q8BMF5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grik4Q8BMF5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grik4Q8BMF5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Grik4Q8BMF5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grik4Q8BMF5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grik4Q8BMF5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grik4Q8BMF5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grik4Q8BMF5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grik4Q8BMF5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grik4Q8BMF5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grik4Q8BMF5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grik4Q8BMF5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grik4Q8BMF5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Grik4Q8BMF5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grik4Q8BMF5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grik4Q8BMF5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grik4Q8BMF5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 229.3 ms