Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnot1Q6ZQ08 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot1Q6ZQ08 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot1Q6ZQ08 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot1Q6ZQ08 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot1Q6ZQ08 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot1Q6ZQ08 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot1Q6ZQ08 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot1Q6ZQ08 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot1Q6ZQ08 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot1Q6ZQ08 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot1Q6ZQ08 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnot1Q6ZQ08 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnot1Q6ZQ08 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnot1Q6ZQ08 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnot1Q6ZQ08 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnot1Q6ZQ08 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnot1Q6ZQ08 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnot1Q6ZQ08 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnot1Q6ZQ08 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot1Q6ZQ08 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot1Q6ZQ08 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot1Q6ZQ08 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot1Q6ZQ08 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot1Q6ZQ08 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot1Q6ZQ08 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot1Q6ZQ08 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot1Q6ZQ08 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot1Q6ZQ08 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot1Q6ZQ08 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot1Q6ZQ08 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot1Q6ZQ08 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot1Q6ZQ08 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot1Q6ZQ08 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot1Q6ZQ08 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot1Q6ZQ08 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot1Q6ZQ08 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot1Q6ZQ08 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot1Q6ZQ08 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot1Q6ZQ08 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot1Q6ZQ08 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cnot1Q6ZQ08 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cnot1Q6ZQ08 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cnot1Q6ZQ08 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot1Q6ZQ08 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms