Protein–RNA interactions for Protein: Q6RKD8

Flrt1, Leucine-rich repeat transmembrane protein FLRT1, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flrt1Q6RKD8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Flrt1Q6RKD8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Flrt1Q6RKD8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Flrt1Q6RKD8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Flrt1Q6RKD8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Flrt1Q6RKD8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Flrt1Q6RKD8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Flrt1Q6RKD8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Flrt1Q6RKD8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Flrt1Q6RKD8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Flrt1Q6RKD8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Flrt1Q6RKD8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Flrt1Q6RKD8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms