Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Szrd1Q6NXN1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Szrd1Q6NXN1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171.2 ms