Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFV6

Fndc3c1, Fibronectin type III domain containing protein 3C1, mousemouse

Predictions only

Length 1,356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3c1Q6DFV6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fndc3c1Q6DFV6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fndc3c1Q6DFV6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fndc3c1Q6DFV6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fndc3c1Q6DFV6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fndc3c1Q6DFV6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fndc3c1Q6DFV6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fndc3c1Q6DFV6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fndc3c1Q6DFV6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fndc3c1Q6DFV6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fndc3c1Q6DFV6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fndc3c1Q6DFV6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fndc3c1Q6DFV6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fndc3c1Q6DFV6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc3c1Q6DFV6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc3c1Q6DFV6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc3c1Q6DFV6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc3c1Q6DFV6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc3c1Q6DFV6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc3c1Q6DFV6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc3c1Q6DFV6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc3c1Q6DFV6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fndc3c1Q6DFV6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fndc3c1Q6DFV6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fndc3c1Q6DFV6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fndc3c1Q6DFV6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Fndc3c1Q6DFV6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fndc3c1Q6DFV6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fndc3c1Q6DFV6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fndc3c1Q6DFV6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fndc3c1Q6DFV6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fndc3c1Q6DFV6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fndc3c1Q6DFV6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fndc3c1Q6DFV6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fndc3c1Q6DFV6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fndc3c1Q6DFV6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fndc3c1Q6DFV6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fndc3c1Q6DFV6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fndc3c1Q6DFV6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fndc3c1Q6DFV6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fndc3c1Q6DFV6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fndc3c1Q6DFV6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fndc3c1Q6DFV6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fndc3c1Q6DFV6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fndc3c1Q6DFV6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fndc3c1Q6DFV6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fndc3c1Q6DFV6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fndc3c1Q6DFV6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fndc3c1Q6DFV6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fndc3c1Q6DFV6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms