Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Atg9aQ68FE2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atg9aQ68FE2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atg9aQ68FE2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atg9aQ68FE2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atg9aQ68FE2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Atg9aQ68FE2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atg9aQ68FE2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Atg9aQ68FE2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atg9aQ68FE2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atg9aQ68FE2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atg9aQ68FE2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atg9aQ68FE2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atg9aQ68FE2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atg9aQ68FE2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atg9aQ68FE2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atg9aQ68FE2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Atg9aQ68FE2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Atg9aQ68FE2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atg9aQ68FE2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Atg9aQ68FE2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Atg9aQ68FE2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Atg9aQ68FE2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atg9aQ68FE2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atg9aQ68FE2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atg9aQ68FE2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atg9aQ68FE2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atg9aQ68FE2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atg9aQ68FE2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atg9aQ68FE2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atg9aQ68FE2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atg9aQ68FE2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atg9aQ68FE2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atg9aQ68FE2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atg9aQ68FE2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atg9aQ68FE2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atg9aQ68FE2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atg9aQ68FE2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atg9aQ68FE2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atg9aQ68FE2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atg9aQ68FE2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atg9aQ68FE2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atg9aQ68FE2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atg9aQ68FE2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atg9aQ68FE2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atg9aQ68FE2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atg9aQ68FE2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atg9aQ68FE2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atg9aQ68FE2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atg9aQ68FE2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atg9aQ68FE2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atg9aQ68FE2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atg9aQ68FE2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg9aQ68FE2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg9aQ68FE2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg9aQ68FE2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg9aQ68FE2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg9aQ68FE2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg9aQ68FE2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg9aQ68FE2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg9aQ68FE2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg9aQ68FE2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg9aQ68FE2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg9aQ68FE2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg9aQ68FE2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg9aQ68FE2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg9aQ68FE2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg9aQ68FE2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg9aQ68FE2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg9aQ68FE2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg9aQ68FE2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg9aQ68FE2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg9aQ68FE2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atg9aQ68FE2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atg9aQ68FE2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atg9aQ68FE2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atg9aQ68FE2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atg9aQ68FE2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atg9aQ68FE2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atg9aQ68FE2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atg9aQ68FE2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atg9aQ68FE2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atg9aQ68FE2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atg9aQ68FE2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atg9aQ68FE2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atg9aQ68FE2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Atg9aQ68FE2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atg9aQ68FE2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atg9aQ68FE2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atg9aQ68FE2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atg9aQ68FE2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atg9aQ68FE2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atg9aQ68FE2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Atg9aQ68FE2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atg9aQ68FE2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atg9aQ68FE2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atg9aQ68FE2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atg9aQ68FE2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atg9aQ68FE2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atg9aQ68FE2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
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