Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nlrp4eQ66X19 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nlrp4eQ66X19 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nlrp4eQ66X19 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nlrp4eQ66X19 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nlrp4eQ66X19 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nlrp4eQ66X19 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Nlrp4eQ66X19 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nlrp4eQ66X19 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nlrp4eQ66X19 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nlrp4eQ66X19 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrp4eQ66X19 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrp4eQ66X19 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrp4eQ66X19 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrp4eQ66X19 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrp4eQ66X19 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrp4eQ66X19 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrp4eQ66X19 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp4eQ66X19 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp4eQ66X19 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms