Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Knl1Q66JQ7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Knl1Q66JQ7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Knl1Q66JQ7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Knl1Q66JQ7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Knl1Q66JQ7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Knl1Q66JQ7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Knl1Q66JQ7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Knl1Q66JQ7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Knl1Q66JQ7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Knl1Q66JQ7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Knl1Q66JQ7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Knl1Q66JQ7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Knl1Q66JQ7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Knl1Q66JQ7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Knl1Q66JQ7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Knl1Q66JQ7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Knl1Q66JQ7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Knl1Q66JQ7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Knl1Q66JQ7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Knl1Q66JQ7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Knl1Q66JQ7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Knl1Q66JQ7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Knl1Q66JQ7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Knl1Q66JQ7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Knl1Q66JQ7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Knl1Q66JQ7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Knl1Q66JQ7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Knl1Q66JQ7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Knl1Q66JQ7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Knl1Q66JQ7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Knl1Q66JQ7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Knl1Q66JQ7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Knl1Q66JQ7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Knl1Q66JQ7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Knl1Q66JQ7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Knl1Q66JQ7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Knl1Q66JQ7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Knl1Q66JQ7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Knl1Q66JQ7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Knl1Q66JQ7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Knl1Q66JQ7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Knl1Q66JQ7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Knl1Q66JQ7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Knl1Q66JQ7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Knl1Q66JQ7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Knl1Q66JQ7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Knl1Q66JQ7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Knl1Q66JQ7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Knl1Q66JQ7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Knl1Q66JQ7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Knl1Q66JQ7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Knl1Q66JQ7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Knl1Q66JQ7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Knl1Q66JQ7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Knl1Q66JQ7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Knl1Q66JQ7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Knl1Q66JQ7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Knl1Q66JQ7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Knl1Q66JQ7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Knl1Q66JQ7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Knl1Q66JQ7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Knl1Q66JQ7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Knl1Q66JQ7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Knl1Q66JQ7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Knl1Q66JQ7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Knl1Q66JQ7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Knl1Q66JQ7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Knl1Q66JQ7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Knl1Q66JQ7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Knl1Q66JQ7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Knl1Q66JQ7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Knl1Q66JQ7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Knl1Q66JQ7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Knl1Q66JQ7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Knl1Q66JQ7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Knl1Q66JQ7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Knl1Q66JQ7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Knl1Q66JQ7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Knl1Q66JQ7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Knl1Q66JQ7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Knl1Q66JQ7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Knl1Q66JQ7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Knl1Q66JQ7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Knl1Q66JQ7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Knl1Q66JQ7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Knl1Q66JQ7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Knl1Q66JQ7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Knl1Q66JQ7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Knl1Q66JQ7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Knl1Q66JQ7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Knl1Q66JQ7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Knl1Q66JQ7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Knl1Q66JQ7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Knl1Q66JQ7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Knl1Q66JQ7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Knl1Q66JQ7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Knl1Q66JQ7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Knl1Q66JQ7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Knl1Q66JQ7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.5 ms