Protein–RNA interactions for Protein: Q60753

Ctf1, Cardiotrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctf1Q60753 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctf1Q60753 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctf1Q60753 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctf1Q60753 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctf1Q60753 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctf1Q60753 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctf1Q60753 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctf1Q60753 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctf1Q60753 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctf1Q60753 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctf1Q60753 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctf1Q60753 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctf1Q60753 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctf1Q60753 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctf1Q60753 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctf1Q60753 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctf1Q60753 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctf1Q60753 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctf1Q60753 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctf1Q60753 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctf1Q60753 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctf1Q60753 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctf1Q60753 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctf1Q60753 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctf1Q60753 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctf1Q60753 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ctf1Q60753 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctf1Q60753 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctf1Q60753 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctf1Q60753 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctf1Q60753 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctf1Q60753 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms