Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Prkaa1Q5EG47 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Prkaa1Q5EG47 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Prkaa1Q5EG47 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Prkaa1Q5EG47 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Prkaa1Q5EG47 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Prkaa1Q5EG47 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Prkaa1Q5EG47 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Prkaa1Q5EG47 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Prkaa1Q5EG47 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Prkaa1Q5EG47 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Prkaa1Q5EG47 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Prkaa1Q5EG47 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Prkaa1Q5EG47 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Prkaa1Q5EG47 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Prkaa1Q5EG47 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Prkaa1Q5EG47 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Prkaa1Q5EG47 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Prkaa1Q5EG47 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Prkaa1Q5EG47 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Prkaa1Q5EG47 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Prkaa1Q5EG47 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Prkaa1Q5EG47 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Prkaa1Q5EG47 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Prkaa1Q5EG47 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Prkaa1Q5EG47 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Prkaa1Q5EG47 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Prkaa1Q5EG47 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Prkaa1Q5EG47 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Prkaa1Q5EG47 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Prkaa1Q5EG47 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Prkaa1Q5EG47 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Prkaa1Q5EG47 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Prkaa1Q5EG47 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Prkaa1Q5EG47 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Prkaa1Q5EG47 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Prkaa1Q5EG47 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Prkaa1Q5EG47 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Prkaa1Q5EG47 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Prkaa1Q5EG47 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Prkaa1Q5EG47 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Prkaa1Q5EG47 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Prkaa1Q5EG47 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Prkaa1Q5EG47 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Prkaa1Q5EG47 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Prkaa1Q5EG47 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Prkaa1Q5EG47 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Prkaa1Q5EG47 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Prkaa1Q5EG47 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Prkaa1Q5EG47 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Prkaa1Q5EG47 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Prkaa1Q5EG47 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Prkaa1Q5EG47 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Prkaa1Q5EG47 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms