Protein–RNA interactions for Protein: Q571F5

Spsb3, SPRY domain-containing SOCS box protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb3Q571F5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spsb3Q571F5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spsb3Q571F5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Spsb3Q571F5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spsb3Q571F5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spsb3Q571F5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spsb3Q571F5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spsb3Q571F5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spsb3Q571F5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spsb3Q571F5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spsb3Q571F5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spsb3Q571F5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spsb3Q571F5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spsb3Q571F5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spsb3Q571F5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Spsb3Q571F5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spsb3Q571F5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spsb3Q571F5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spsb3Q571F5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spsb3Q571F5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spsb3Q571F5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spsb3Q571F5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spsb3Q571F5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spsb3Q571F5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spsb3Q571F5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spsb3Q571F5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spsb3Q571F5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spsb3Q571F5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Spsb3Q571F5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spsb3Q571F5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spsb3Q571F5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spsb3Q571F5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spsb3Q571F5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spsb3Q571F5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spsb3Q571F5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spsb3Q571F5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spsb3Q571F5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spsb3Q571F5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spsb3Q571F5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spsb3Q571F5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spsb3Q571F5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spsb3Q571F5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spsb3Q571F5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spsb3Q571F5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spsb3Q571F5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spsb3Q571F5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spsb3Q571F5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spsb3Q571F5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spsb3Q571F5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spsb3Q571F5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spsb3Q571F5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms