Protein–RNA interactions for Protein: Q56A06

Tmtc2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc2Q56A06 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmtc2Q56A06 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmtc2Q56A06 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmtc2Q56A06 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmtc2Q56A06 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmtc2Q56A06 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmtc2Q56A06 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmtc2Q56A06 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmtc2Q56A06 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmtc2Q56A06 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmtc2Q56A06 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmtc2Q56A06 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmtc2Q56A06 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmtc2Q56A06 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmtc2Q56A06 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmtc2Q56A06 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmtc2Q56A06 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tmtc2Q56A06 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmtc2Q56A06 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmtc2Q56A06 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmtc2Q56A06 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmtc2Q56A06 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmtc2Q56A06 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmtc2Q56A06 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmtc2Q56A06 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmtc2Q56A06 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmtc2Q56A06 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmtc2Q56A06 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmtc2Q56A06 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmtc2Q56A06 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmtc2Q56A06 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmtc2Q56A06 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmtc2Q56A06 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmtc2Q56A06 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmtc2Q56A06 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmtc2Q56A06 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmtc2Q56A06 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmtc2Q56A06 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmtc2Q56A06 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmtc2Q56A06 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmtc2Q56A06 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmtc2Q56A06 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmtc2Q56A06 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmtc2Q56A06 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmtc2Q56A06 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmtc2Q56A06 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmtc2Q56A06 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmtc2Q56A06 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmtc2Q56A06 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmtc2Q56A06 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmtc2Q56A06 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmtc2Q56A06 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmtc2Q56A06 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmtc2Q56A06 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmtc2Q56A06 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmtc2Q56A06 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmtc2Q56A06 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmtc2Q56A06 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmtc2Q56A06 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmtc2Q56A06 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmtc2Q56A06 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmtc2Q56A06 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmtc2Q56A06 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmtc2Q56A06 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmtc2Q56A06 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmtc2Q56A06 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmtc2Q56A06 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tmtc2Q56A06 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmtc2Q56A06 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmtc2Q56A06 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmtc2Q56A06 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmtc2Q56A06 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmtc2Q56A06 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmtc2Q56A06 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmtc2Q56A06 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmtc2Q56A06 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmtc2Q56A06 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmtc2Q56A06 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmtc2Q56A06 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmtc2Q56A06 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmtc2Q56A06 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmtc2Q56A06 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmtc2Q56A06 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmtc2Q56A06 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmtc2Q56A06 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmtc2Q56A06 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmtc2Q56A06 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmtc2Q56A06 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmtc2Q56A06 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmtc2Q56A06 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmtc2Q56A06 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmtc2Q56A06 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmtc2Q56A06 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmtc2Q56A06 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmtc2Q56A06 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmtc2Q56A06 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmtc2Q56A06 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmtc2Q56A06 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmtc2Q56A06 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmtc2Q56A06 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms