Protein–RNA interactions for Protein: Q4FK66

Prpf38a, Pre-mRNA-splicing factor 38A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf38aQ4FK66 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf38aQ4FK66 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf38aQ4FK66 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf38aQ4FK66 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf38aQ4FK66 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf38aQ4FK66 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf38aQ4FK66 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf38aQ4FK66 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf38aQ4FK66 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prpf38aQ4FK66 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Prpf38aQ4FK66 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf38aQ4FK66 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf38aQ4FK66 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf38aQ4FK66 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf38aQ4FK66 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf38aQ4FK66 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf38aQ4FK66 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf38aQ4FK66 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf38aQ4FK66 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf38aQ4FK66 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf38aQ4FK66 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf38aQ4FK66 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf38aQ4FK66 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf38aQ4FK66 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf38aQ4FK66 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf38aQ4FK66 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf38aQ4FK66 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf38aQ4FK66 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf38aQ4FK66 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf38aQ4FK66 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf38aQ4FK66 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf38aQ4FK66 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf38aQ4FK66 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf38aQ4FK66 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf38aQ4FK66 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf38aQ4FK66 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf38aQ4FK66 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf38aQ4FK66 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf38aQ4FK66 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf38aQ4FK66 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms