Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
4930567H17RikQ3V0K5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
4930567H17RikQ3V0K5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
4930567H17RikQ3V0K5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
4930567H17RikQ3V0K5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
4930567H17RikQ3V0K5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
4930567H17RikQ3V0K5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
4930567H17RikQ3V0K5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
4930567H17RikQ3V0K5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
4930567H17RikQ3V0K5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
4930567H17RikQ3V0K5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
4930567H17RikQ3V0K5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
4930567H17RikQ3V0K5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
4930567H17RikQ3V0K5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
4930567H17RikQ3V0K5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
4930567H17RikQ3V0K5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
4930567H17RikQ3V0K5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
4930567H17RikQ3V0K5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
4930567H17RikQ3V0K5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
4930567H17RikQ3V0K5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
4930567H17RikQ3V0K5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
4930567H17RikQ3V0K5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
4930567H17RikQ3V0K5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
4930567H17RikQ3V0K5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
4930567H17RikQ3V0K5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
4930567H17RikQ3V0K5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
4930567H17RikQ3V0K5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
4930567H17RikQ3V0K5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
4930567H17RikQ3V0K5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
4930567H17RikQ3V0K5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
4930567H17RikQ3V0K5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
4930567H17RikQ3V0K5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
4930567H17RikQ3V0K5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
4930567H17RikQ3V0K5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
4930567H17RikQ3V0K5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
4930567H17RikQ3V0K5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
4930567H17RikQ3V0K5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
4930567H17RikQ3V0K5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
4930567H17RikQ3V0K5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
4930567H17RikQ3V0K5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
4930567H17RikQ3V0K5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
4930567H17RikQ3V0K5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
4930567H17RikQ3V0K5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
4930567H17RikQ3V0K5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
4930567H17RikQ3V0K5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
4930567H17RikQ3V0K5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
4930567H17RikQ3V0K5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
4930567H17RikQ3V0K5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
4930567H17RikQ3V0K5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
4930567H17RikQ3V0K5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
4930567H17RikQ3V0K5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
4930567H17RikQ3V0K5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
4930567H17RikQ3V0K5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
4930567H17RikQ3V0K5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
4930567H17RikQ3V0K5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
4930567H17RikQ3V0K5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
4930567H17RikQ3V0K5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
4930567H17RikQ3V0K5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
4930567H17RikQ3V0K5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms