Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl4Q3URY0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtl4Q3URY0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms