Protein–RNA interactions for Protein: Q3URJ8

Nkain3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain3Q3URJ8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkain3Q3URJ8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkain3Q3URJ8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkain3Q3URJ8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkain3Q3URJ8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkain3Q3URJ8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkain3Q3URJ8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkain3Q3URJ8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkain3Q3URJ8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkain3Q3URJ8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkain3Q3URJ8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkain3Q3URJ8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkain3Q3URJ8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkain3Q3URJ8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkain3Q3URJ8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkain3Q3URJ8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkain3Q3URJ8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkain3Q3URJ8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkain3Q3URJ8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkain3Q3URJ8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkain3Q3URJ8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkain3Q3URJ8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkain3Q3URJ8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkain3Q3URJ8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkain3Q3URJ8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkain3Q3URJ8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkain3Q3URJ8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkain3Q3URJ8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkain3Q3URJ8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkain3Q3URJ8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkain3Q3URJ8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkain3Q3URJ8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkain3Q3URJ8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkain3Q3URJ8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkain3Q3URJ8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkain3Q3URJ8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkain3Q3URJ8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkain3Q3URJ8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkain3Q3URJ8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkain3Q3URJ8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkain3Q3URJ8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkain3Q3URJ8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkain3Q3URJ8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkain3Q3URJ8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkain3Q3URJ8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkain3Q3URJ8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkain3Q3URJ8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkain3Q3URJ8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkain3Q3URJ8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkain3Q3URJ8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nkain3Q3URJ8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nkain3Q3URJ8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkain3Q3URJ8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkain3Q3URJ8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkain3Q3URJ8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkain3Q3URJ8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkain3Q3URJ8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkain3Q3URJ8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkain3Q3URJ8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkain3Q3URJ8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkain3Q3URJ8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkain3Q3URJ8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkain3Q3URJ8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkain3Q3URJ8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkain3Q3URJ8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkain3Q3URJ8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkain3Q3URJ8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkain3Q3URJ8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkain3Q3URJ8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkain3Q3URJ8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkain3Q3URJ8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkain3Q3URJ8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkain3Q3URJ8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkain3Q3URJ8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkain3Q3URJ8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkain3Q3URJ8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkain3Q3URJ8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkain3Q3URJ8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkain3Q3URJ8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkain3Q3URJ8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkain3Q3URJ8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkain3Q3URJ8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkain3Q3URJ8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkain3Q3URJ8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkain3Q3URJ8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkain3Q3URJ8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkain3Q3URJ8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkain3Q3URJ8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkain3Q3URJ8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkain3Q3URJ8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkain3Q3URJ8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nkain3Q3URJ8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nkain3Q3URJ8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nkain3Q3URJ8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nkain3Q3URJ8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nkain3Q3URJ8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nkain3Q3URJ8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nkain3Q3URJ8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nkain3Q3URJ8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nkain3Q3URJ8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms