Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Lmod2Q3UHZ5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Lmod2Q3UHZ5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Lmod2Q3UHZ5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Lmod2Q3UHZ5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Lmod2Q3UHZ5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Lmod2Q3UHZ5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Lmod2Q3UHZ5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Lmod2Q3UHZ5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Lmod2Q3UHZ5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Lmod2Q3UHZ5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Lmod2Q3UHZ5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Lmod2Q3UHZ5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Lmod2Q3UHZ5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Lmod2Q3UHZ5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Lmod2Q3UHZ5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Lmod2Q3UHZ5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Lmod2Q3UHZ5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Lmod2Q3UHZ5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Lmod2Q3UHZ5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Lmod2Q3UHZ5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Lmod2Q3UHZ5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Lmod2Q3UHZ5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Lmod2Q3UHZ5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Lmod2Q3UHZ5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Lmod2Q3UHZ5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Lmod2Q3UHZ5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Lmod2Q3UHZ5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Lmod2Q3UHZ5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Lmod2Q3UHZ5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Lmod2Q3UHZ5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Lmod2Q3UHZ5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Lmod2Q3UHZ5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Lmod2Q3UHZ5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Lmod2Q3UHZ5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Lmod2Q3UHZ5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Lmod2Q3UHZ5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Lmod2Q3UHZ5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Lmod2Q3UHZ5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Lmod2Q3UHZ5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Lmod2Q3UHZ5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Lmod2Q3UHZ5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Lmod2Q3UHZ5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Lmod2Q3UHZ5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Lmod2Q3UHZ5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Lmod2Q3UHZ5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Lmod2Q3UHZ5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Lmod2Q3UHZ5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Lmod2Q3UHZ5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Lmod2Q3UHZ5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Lmod2Q3UHZ5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Lmod2Q3UHZ5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lmod2Q3UHZ5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Lmod2Q3UHZ5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lmod2Q3UHZ5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lmod2Q3UHZ5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lmod2Q3UHZ5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Lmod2Q3UHZ5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Lmod2Q3UHZ5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Lmod2Q3UHZ5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Lmod2Q3UHZ5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Lmod2Q3UHZ5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Lmod2Q3UHZ5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Lmod2Q3UHZ5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Lmod2Q3UHZ5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Lmod2Q3UHZ5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Lmod2Q3UHZ5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Lmod2Q3UHZ5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Lmod2Q3UHZ5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Lmod2Q3UHZ5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Lmod2Q3UHZ5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Lmod2Q3UHZ5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Lmod2Q3UHZ5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Lmod2Q3UHZ5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Lmod2Q3UHZ5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Lmod2Q3UHZ5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Lmod2Q3UHZ5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Lmod2Q3UHZ5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Lmod2Q3UHZ5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Lmod2Q3UHZ5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Lmod2Q3UHZ5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Lmod2Q3UHZ5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lmod2Q3UHZ5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lmod2Q3UHZ5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lmod2Q3UHZ5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lmod2Q3UHZ5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lmod2Q3UHZ5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lmod2Q3UHZ5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lmod2Q3UHZ5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lmod2Q3UHZ5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lmod2Q3UHZ5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Lmod2Q3UHZ5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Lmod2Q3UHZ5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Lmod2Q3UHZ5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Lmod2Q3UHZ5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Lmod2Q3UHZ5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Lmod2Q3UHZ5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Lmod2Q3UHZ5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Lmod2Q3UHZ5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Lmod2Q3UHZ5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms