Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srsf6Q3TWW8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srsf6Q3TWW8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srsf6Q3TWW8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srsf6Q3TWW8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srsf6Q3TWW8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srsf6Q3TWW8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srsf6Q3TWW8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srsf6Q3TWW8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srsf6Q3TWW8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srsf6Q3TWW8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srsf6Q3TWW8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srsf6Q3TWW8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srsf6Q3TWW8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srsf6Q3TWW8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srsf6Q3TWW8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srsf6Q3TWW8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srsf6Q3TWW8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srsf6Q3TWW8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srsf6Q3TWW8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srsf6Q3TWW8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srsf6Q3TWW8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srsf6Q3TWW8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srsf6Q3TWW8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Srsf6Q3TWW8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srsf6Q3TWW8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srsf6Q3TWW8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srsf6Q3TWW8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srsf6Q3TWW8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srsf6Q3TWW8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srsf6Q3TWW8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srsf6Q3TWW8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srsf6Q3TWW8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srsf6Q3TWW8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srsf6Q3TWW8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srsf6Q3TWW8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srsf6Q3TWW8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srsf6Q3TWW8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srsf6Q3TWW8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srsf6Q3TWW8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srsf6Q3TWW8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srsf6Q3TWW8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srsf6Q3TWW8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srsf6Q3TWW8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srsf6Q3TWW8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srsf6Q3TWW8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srsf6Q3TWW8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srsf6Q3TWW8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Srsf6Q3TWW8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Srsf6Q3TWW8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Srsf6Q3TWW8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Srsf6Q3TWW8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Srsf6Q3TWW8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Srsf6Q3TWW8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Srsf6Q3TWW8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srsf6Q3TWW8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srsf6Q3TWW8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srsf6Q3TWW8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srsf6Q3TWW8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srsf6Q3TWW8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Srsf6Q3TWW8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srsf6Q3TWW8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srsf6Q3TWW8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srsf6Q3TWW8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srsf6Q3TWW8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srsf6Q3TWW8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srsf6Q3TWW8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srsf6Q3TWW8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Srsf6Q3TWW8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Srsf6Q3TWW8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Srsf6Q3TWW8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Srsf6Q3TWW8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Srsf6Q3TWW8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Srsf6Q3TWW8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Srsf6Q3TWW8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Srsf6Q3TWW8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Srsf6Q3TWW8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Srsf6Q3TWW8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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