Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TchpQ3TVW5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TchpQ3TVW5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TchpQ3TVW5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TchpQ3TVW5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TchpQ3TVW5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TchpQ3TVW5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TchpQ3TVW5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TchpQ3TVW5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TchpQ3TVW5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TchpQ3TVW5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TchpQ3TVW5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TchpQ3TVW5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TchpQ3TVW5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TchpQ3TVW5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TchpQ3TVW5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TchpQ3TVW5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TchpQ3TVW5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TchpQ3TVW5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TchpQ3TVW5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TchpQ3TVW5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TchpQ3TVW5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TchpQ3TVW5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TchpQ3TVW5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TchpQ3TVW5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TchpQ3TVW5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TchpQ3TVW5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TchpQ3TVW5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TchpQ3TVW5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TchpQ3TVW5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TchpQ3TVW5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TchpQ3TVW5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TchpQ3TVW5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TchpQ3TVW5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TchpQ3TVW5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TchpQ3TVW5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TchpQ3TVW5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TchpQ3TVW5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TchpQ3TVW5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TchpQ3TVW5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TchpQ3TVW5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TchpQ3TVW5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TchpQ3TVW5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TchpQ3TVW5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TchpQ3TVW5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TchpQ3TVW5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TchpQ3TVW5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TchpQ3TVW5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TchpQ3TVW5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TchpQ3TVW5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TchpQ3TVW5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TchpQ3TVW5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TchpQ3TVW5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TchpQ3TVW5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TchpQ3TVW5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TchpQ3TVW5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TchpQ3TVW5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TchpQ3TVW5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TchpQ3TVW5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TchpQ3TVW5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TchpQ3TVW5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TchpQ3TVW5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TchpQ3TVW5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TchpQ3TVW5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TchpQ3TVW5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TchpQ3TVW5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TchpQ3TVW5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TchpQ3TVW5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TchpQ3TVW5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TchpQ3TVW5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TchpQ3TVW5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TchpQ3TVW5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TchpQ3TVW5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TchpQ3TVW5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TchpQ3TVW5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TchpQ3TVW5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TchpQ3TVW5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TchpQ3TVW5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TchpQ3TVW5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TchpQ3TVW5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TchpQ3TVW5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TchpQ3TVW5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TchpQ3TVW5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TchpQ3TVW5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TchpQ3TVW5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TchpQ3TVW5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TchpQ3TVW5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TchpQ3TVW5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TchpQ3TVW5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TchpQ3TVW5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TchpQ3TVW5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TchpQ3TVW5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TchpQ3TVW5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TchpQ3TVW5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TchpQ3TVW5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TchpQ3TVW5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TchpQ3TVW5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TchpQ3TVW5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TchpQ3TVW5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TchpQ3TVW5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms