Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ptchd1Q14B62 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ptchd1Q14B62 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ptchd1Q14B62 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ptchd1Q14B62 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ptchd1Q14B62 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ptchd1Q14B62 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ptchd1Q14B62 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ptchd1Q14B62 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ptchd1Q14B62 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ptchd1Q14B62 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ptchd1Q14B62 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ptchd1Q14B62 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ptchd1Q14B62 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ptchd1Q14B62 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ptchd1Q14B62 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ptchd1Q14B62 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ptchd1Q14B62 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ptchd1Q14B62 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ptchd1Q14B62 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ptchd1Q14B62 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ptchd1Q14B62 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ptchd1Q14B62 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ptchd1Q14B62 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ptchd1Q14B62 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ptchd1Q14B62 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ptchd1Q14B62 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ptchd1Q14B62 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ptchd1Q14B62 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ptchd1Q14B62 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ptchd1Q14B62 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ptchd1Q14B62 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ptchd1Q14B62 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ptchd1Q14B62 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ptchd1Q14B62 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ptchd1Q14B62 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ptchd1Q14B62 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ptchd1Q14B62 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ptchd1Q14B62 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ptchd1Q14B62 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ptchd1Q14B62 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ptchd1Q14B62 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ptchd1Q14B62 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
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ptchd1Q14B62 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ptchd1Q14B62 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ptchd1Q14B62 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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ptchd1Q14B62 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ptchd1Q14B62 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ptchd1Q14B62 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ptchd1Q14B62 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ptchd1Q14B62 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ptchd1Q14B62 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ptchd1Q14B62 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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ptchd1Q14B62 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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ptchd1Q14B62 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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ptchd1Q14B62 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
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ptchd1Q14B62 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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