Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MitfQ08874 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MitfQ08874 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MitfQ08874 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MitfQ08874 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MitfQ08874 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MitfQ08874 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MitfQ08874 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms