Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Col17a1Q07563 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Col17a1Q07563 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Col17a1Q07563 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Col17a1Q07563 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Col17a1Q07563 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Col17a1Q07563 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Col17a1Q07563 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Col17a1Q07563 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Col17a1Q07563 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Col17a1Q07563 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Col17a1Q07563 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Col17a1Q07563 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Col17a1Q07563 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Col17a1Q07563 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Col17a1Q07563 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Col17a1Q07563 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Col17a1Q07563 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Col17a1Q07563 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Col17a1Q07563 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Col17a1Q07563 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Col17a1Q07563 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Col17a1Q07563 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Col17a1Q07563 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Col17a1Q07563 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Col17a1Q07563 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Col17a1Q07563 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Col17a1Q07563 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Col17a1Q07563 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Col17a1Q07563 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Col17a1Q07563 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Col17a1Q07563 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Col17a1Q07563 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Col17a1Q07563 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Col17a1Q07563 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Col17a1Q07563 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Col17a1Q07563 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Col17a1Q07563 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
Col17a1Q07563 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC30.89■■■□□ 2.53
Col17a1Q07563 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Col17a1Q07563 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Col17a1Q07563 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Col17a1Q07563 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Col17a1Q07563 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Col17a1Q07563 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Col17a1Q07563 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Col17a1Q07563 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Col17a1Q07563 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Col17a1Q07563 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Col17a1Q07563 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Col17a1Q07563 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Col17a1Q07563 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Col17a1Q07563 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Col17a1Q07563 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Col17a1Q07563 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Col17a1Q07563 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Col17a1Q07563 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Col17a1Q07563 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Col17a1Q07563 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Col17a1Q07563 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Col17a1Q07563 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Col17a1Q07563 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Col17a1Q07563 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Col17a1Q07563 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Col17a1Q07563 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Col17a1Q07563 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Col17a1Q07563 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Col17a1Q07563 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Col17a1Q07563 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Col17a1Q07563 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Col17a1Q07563 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Col17a1Q07563 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Col17a1Q07563 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Col17a1Q07563 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Col17a1Q07563 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Col17a1Q07563 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
Col17a1Q07563 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.53
Col17a1Q07563 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
Col17a1Q07563 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Col17a1Q07563 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Col17a1Q07563 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Col17a1Q07563 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Col17a1Q07563 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Col17a1Q07563 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Col17a1Q07563 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Col17a1Q07563 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Col17a1Q07563 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Col17a1Q07563 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Col17a1Q07563 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Col17a1Q07563 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Col17a1Q07563 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Col17a1Q07563 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Col17a1Q07563 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Col17a1Q07563 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Col17a1Q07563 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Col17a1Q07563 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Col17a1Q07563 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Col17a1Q07563 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Col17a1Q07563 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Col17a1Q07563 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms