Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sdr16c6Q05A13 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sdr16c6Q05A13 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sdr16c6Q05A13 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sdr16c6Q05A13 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sdr16c6Q05A13 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.5 ms