Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pfdn6Q03958 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pfdn6Q03958 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pfdn6Q03958 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pfdn6Q03958 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pfdn6Q03958 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pfdn6Q03958 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pfdn6Q03958 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pfdn6Q03958 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pfdn6Q03958 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pfdn6Q03958 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pfdn6Q03958 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pfdn6Q03958 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Pfdn6Q03958 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pfdn6Q03958 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pfdn6Q03958 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pfdn6Q03958 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pfdn6Q03958 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pfdn6Q03958 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pfdn6Q03958 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pfdn6Q03958 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pfdn6Q03958 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pfdn6Q03958 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pfdn6Q03958 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pfdn6Q03958 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pfdn6Q03958 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pfdn6Q03958 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pfdn6Q03958 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pfdn6Q03958 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pfdn6Q03958 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pfdn6Q03958 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pfdn6Q03958 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms