Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
rp9P97762 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
rp9P97762 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
rp9P97762 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
rp9P97762 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
rp9P97762 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
rp9P97762 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
rp9P97762 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
rp9P97762 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
rp9P97762 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
rp9P97762 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
rp9P97762 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
rp9P97762 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
rp9P97762 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
rp9P97762 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
rp9P97762 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
rp9P97762 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
rp9P97762 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
rp9P97762 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
rp9P97762 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
rp9P97762 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
rp9P97762 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
rp9P97762 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
rp9P97762 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
rp9P97762 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
rp9P97762 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
rp9P97762 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
rp9P97762 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
rp9P97762 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
rp9P97762 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
rp9P97762 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
rp9P97762 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
rp9P97762 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
rp9P97762 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
rp9P97762 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
rp9P97762 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
rp9P97762 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
rp9P97762 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
rp9P97762 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
rp9P97762 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
rp9P97762 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
rp9P97762 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
rp9P97762 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
rp9P97762 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
rp9P97762 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
rp9P97762 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
rp9P97762 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
rp9P97762 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
rp9P97762 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
rp9P97762 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
rp9P97762 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
rp9P97762 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
rp9P97762 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
rp9P97762 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
rp9P97762 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
rp9P97762 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
rp9P97762 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
rp9P97762 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
rp9P97762 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
rp9P97762 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
rp9P97762 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
rp9P97762 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
rp9P97762 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
rp9P97762 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
rp9P97762 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
rp9P97762 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
rp9P97762 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
rp9P97762 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
rp9P97762 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
rp9P97762 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
rp9P97762 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
rp9P97762 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
rp9P97762 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
rp9P97762 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
rp9P97762 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
rp9P97762 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
rp9P97762 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
rp9P97762 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
rp9P97762 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
rp9P97762 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
rp9P97762 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
rp9P97762 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
rp9P97762 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
rp9P97762 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
rp9P97762 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
rp9P97762 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
rp9P97762 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
rp9P97762 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
rp9P97762 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
rp9P97762 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
rp9P97762 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
rp9P97762 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
rp9P97762 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
rp9P97762 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
rp9P97762 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
rp9P97762 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
rp9P97762 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
rp9P97762 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
rp9P97762 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
rp9P97762 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms