Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Taf1bP97358 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Taf1bP97358 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Taf1bP97358 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Taf1bP97358 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Taf1bP97358 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Taf1bP97358 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Taf1bP97358 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Taf1bP97358 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Taf1bP97358 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Taf1bP97358 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Taf1bP97358 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Taf1bP97358 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Taf1bP97358 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Taf1bP97358 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Taf1bP97358 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Taf1bP97358 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Taf1bP97358 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Taf1bP97358 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Taf1bP97358 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Taf1bP97358 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Taf1bP97358 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Taf1bP97358 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Taf1bP97358 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Taf1bP97358 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Taf1bP97358 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Taf1bP97358 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Taf1bP97358 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Taf1bP97358 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Taf1bP97358 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Taf1bP97358 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Taf1bP97358 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf1bP97358 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf1bP97358 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf1bP97358 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf1bP97358 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf1bP97358 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf1bP97358 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Taf1bP97358 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Taf1bP97358 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Taf1bP97358 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Taf1bP97358 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Taf1bP97358 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Taf1bP97358 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Taf1bP97358 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Taf1bP97358 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Taf1bP97358 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Taf1bP97358 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Taf1bP97358 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Taf1bP97358 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Taf1bP97358 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Taf1bP97358 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Taf1bP97358 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Taf1bP97358 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Taf1bP97358 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Taf1bP97358 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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Taf1bP97358 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Taf1bP97358 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Taf1bP97358 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Taf1bP97358 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Taf1bP97358 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Taf1bP97358 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Taf1bP97358 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
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Taf1bP97358 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Taf1bP97358 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Taf1bP97358 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Taf1bP97358 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Taf1bP97358 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Taf1bP97358 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Taf1bP97358 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Taf1bP97358 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Taf1bP97358 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Taf1bP97358 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Taf1bP97358 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Taf1bP97358 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Taf1bP97358 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Taf1bP97358 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Taf1bP97358 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Taf1bP97358 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Taf1bP97358 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Taf1bP97358 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Taf1bP97358 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Taf1bP97358 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Taf1bP97358 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Taf1bP97358 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Taf1bP97358 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Taf1bP97358 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Taf1bP97358 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Taf1bP97358 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Taf1bP97358 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Taf1bP97358 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Taf1bP97358 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Taf1bP97358 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Taf1bP97358 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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