Protein–RNA interactions for Protein: P61148

Fgf1, Fibroblast growth factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf1P61148 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fgf1P61148 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms