Protein–RNA interactions for Protein: P56960

Exosc10, Exosome component 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc10P56960 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Exosc10P56960 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Exosc10P56960 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Exosc10P56960 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Exosc10P56960 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Exosc10P56960 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Exosc10P56960 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Exosc10P56960 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Exosc10P56960 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Exosc10P56960 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Exosc10P56960 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Exosc10P56960 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Exosc10P56960 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Exosc10P56960 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Exosc10P56960 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Exosc10P56960 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Exosc10P56960 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Exosc10P56960 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Exosc10P56960 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Exosc10P56960 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Exosc10P56960 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Exosc10P56960 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Exosc10P56960 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Exosc10P56960 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Exosc10P56960 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Exosc10P56960 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Exosc10P56960 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Exosc10P56960 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Exosc10P56960 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Exosc10P56960 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Exosc10P56960 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Exosc10P56960 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Exosc10P56960 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Exosc10P56960 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Exosc10P56960 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Exosc10P56960 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Exosc10P56960 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Exosc10P56960 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Exosc10P56960 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Exosc10P56960 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Exosc10P56960 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Exosc10P56960 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Exosc10P56960 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Exosc10P56960 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Exosc10P56960 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Exosc10P56960 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Exosc10P56960 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Exosc10P56960 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Exosc10P56960 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Exosc10P56960 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Exosc10P56960 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Exosc10P56960 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Exosc10P56960 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Exosc10P56960 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Exosc10P56960 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Exosc10P56960 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Exosc10P56960 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Exosc10P56960 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Exosc10P56960 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Exosc10P56960 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Exosc10P56960 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Exosc10P56960 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Exosc10P56960 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Exosc10P56960 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Exosc10P56960 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Exosc10P56960 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Exosc10P56960 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Exosc10P56960 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Exosc10P56960 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Exosc10P56960 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Exosc10P56960 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Exosc10P56960 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Exosc10P56960 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Exosc10P56960 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Exosc10P56960 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Exosc10P56960 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Exosc10P56960 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Exosc10P56960 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Exosc10P56960 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Exosc10P56960 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Exosc10P56960 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Exosc10P56960 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Exosc10P56960 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Exosc10P56960 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Exosc10P56960 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Exosc10P56960 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Exosc10P56960 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Exosc10P56960 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Exosc10P56960 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Exosc10P56960 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Exosc10P56960 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Exosc10P56960 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Exosc10P56960 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Exosc10P56960 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Exosc10P56960 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Exosc10P56960 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Exosc10P56960 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Exosc10P56960 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Exosc10P56960 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Exosc10P56960 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms