Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NrlP54846 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NrlP54846 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NrlP54846 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NrlP54846 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NrlP54846 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NrlP54846 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NrlP54846 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NrlP54846 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NrlP54846 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NrlP54846 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NrlP54846 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NrlP54846 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NrlP54846 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NrlP54846 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NrlP54846 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NrlP54846 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NrlP54846 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NrlP54846 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NrlP54846 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NrlP54846 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NrlP54846 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NrlP54846 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NrlP54846 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NrlP54846 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NrlP54846 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NrlP54846 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NrlP54846 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NrlP54846 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NrlP54846 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NrlP54846 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NrlP54846 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NrlP54846 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NrlP54846 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NrlP54846 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NrlP54846 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NrlP54846 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NrlP54846 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NrlP54846 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NrlP54846 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NrlP54846 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NrlP54846 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NrlP54846 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NrlP54846 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NrlP54846 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NrlP54846 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NrlP54846 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NrlP54846 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NrlP54846 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NrlP54846 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NrlP54846 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NrlP54846 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NrlP54846 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NrlP54846 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NrlP54846 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NrlP54846 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NrlP54846 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NrlP54846 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NrlP54846 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NrlP54846 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NrlP54846 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NrlP54846 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NrlP54846 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NrlP54846 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NrlP54846 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NrlP54846 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NrlP54846 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NrlP54846 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NrlP54846 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NrlP54846 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NrlP54846 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NrlP54846 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NrlP54846 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NrlP54846 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NrlP54846 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NrlP54846 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NrlP54846 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NrlP54846 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NrlP54846 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NrlP54846 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NrlP54846 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NrlP54846 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NrlP54846 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NrlP54846 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NrlP54846 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NrlP54846 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NrlP54846 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
NrlP54846 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NrlP54846 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NrlP54846 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NrlP54846 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NrlP54846 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NrlP54846 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NrlP54846 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NrlP54846 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NrlP54846 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NrlP54846 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NrlP54846 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NrlP54846 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NrlP54846 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms