Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Upp1P52624 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Upp1P52624 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Upp1P52624 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Upp1P52624 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Upp1P52624 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Upp1P52624 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Upp1P52624 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Upp1P52624 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Upp1P52624 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Upp1P52624 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Upp1P52624 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Upp1P52624 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Upp1P52624 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Upp1P52624 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Upp1P52624 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Upp1P52624 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Upp1P52624 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Upp1P52624 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Upp1P52624 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Upp1P52624 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Upp1P52624 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Upp1P52624 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Upp1P52624 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Upp1P52624 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Upp1P52624 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Upp1P52624 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Upp1P52624 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Upp1P52624 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Upp1P52624 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Upp1P52624 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Upp1P52624 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Upp1P52624 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Upp1P52624 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Upp1P52624 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Upp1P52624 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Upp1P52624 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Upp1P52624 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Upp1P52624 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Upp1P52624 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Upp1P52624 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Upp1P52624 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Upp1P52624 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Upp1P52624 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Upp1P52624 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Upp1P52624 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Upp1P52624 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Upp1P52624 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Upp1P52624 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Upp1P52624 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Upp1P52624 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Upp1P52624 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Upp1P52624 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Upp1P52624 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Upp1P52624 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Upp1P52624 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Upp1P52624 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Upp1P52624 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Upp1P52624 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Upp1P52624 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Upp1P52624 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Upp1P52624 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Upp1P52624 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms