Protein–RNA interactions for Protein: P48757

Gast, Gastrin, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GastP48757 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GastP48757 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GastP48757 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GastP48757 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GastP48757 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GastP48757 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GastP48757 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GastP48757 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GastP48757 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GastP48757 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GastP48757 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GastP48757 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GastP48757 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GastP48757 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GastP48757 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GastP48757 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GastP48757 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GastP48757 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GastP48757 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GastP48757 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GastP48757 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GastP48757 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GastP48757 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GastP48757 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GastP48757 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GastP48757 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GastP48757 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GastP48757 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GastP48757 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GastP48757 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GastP48757 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GastP48757 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GastP48757 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GastP48757 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GastP48757 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GastP48757 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GastP48757 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GastP48757 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GastP48757 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GastP48757 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GastP48757 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GastP48757 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GastP48757 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GastP48757 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GastP48757 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GastP48757 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GastP48757 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GastP48757 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GastP48757 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GastP48757 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GastP48757 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GastP48757 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GastP48757 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GastP48757 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GastP48757 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GastP48757 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GastP48757 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GastP48757 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GastP48757 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GastP48757 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GastP48757 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GastP48757 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GastP48757 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GastP48757 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GastP48757 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GastP48757 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GastP48757 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GastP48757 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GastP48757 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GastP48757 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GastP48757 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GastP48757 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GastP48757 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GastP48757 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GastP48757 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GastP48757 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GastP48757 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GastP48757 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GastP48757 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GastP48757 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GastP48757 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GastP48757 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GastP48757 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GastP48757 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GastP48757 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GastP48757 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GastP48757 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GastP48757 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GastP48757 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GastP48757 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GastP48757 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GastP48757 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GastP48757 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GastP48757 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GastP48757 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GastP48757 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GastP48757 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GastP48757 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GastP48757 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
GastP48757 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms