Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ly6dP35459 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ly6dP35459 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ly6dP35459 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ly6dP35459 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ly6dP35459 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ly6dP35459 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ly6dP35459 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ly6dP35459 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ly6dP35459 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ly6dP35459 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ly6dP35459 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ly6dP35459 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ly6dP35459 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ly6dP35459 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ly6dP35459 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ly6dP35459 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ly6dP35459 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ly6dP35459 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ly6dP35459 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ly6dP35459 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ly6dP35459 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ly6dP35459 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ly6dP35459 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ly6dP35459 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ly6dP35459 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ly6dP35459 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ly6dP35459 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ly6dP35459 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ly6dP35459 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ly6dP35459 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ly6dP35459 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ly6dP35459 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ly6dP35459 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ly6dP35459 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ly6dP35459 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ly6dP35459 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ly6dP35459 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ly6dP35459 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ly6dP35459 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ly6dP35459 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ly6dP35459 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ly6dP35459 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ly6dP35459 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ly6dP35459 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ly6dP35459 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ly6dP35459 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ly6dP35459 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ly6dP35459 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ly6dP35459 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ly6dP35459 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Ly6dP35459 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ly6dP35459 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ly6dP35459 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ly6dP35459 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ly6dP35459 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ly6dP35459 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ly6dP35459 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ly6dP35459 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ly6dP35459 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ly6dP35459 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ly6dP35459 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ly6dP35459 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ly6dP35459 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ly6dP35459 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ly6dP35459 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ly6dP35459 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ly6dP35459 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ly6dP35459 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ly6dP35459 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ly6dP35459 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ly6dP35459 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ly6dP35459 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ly6dP35459 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ly6dP35459 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ly6dP35459 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ly6dP35459 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ly6dP35459 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ly6dP35459 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ly6dP35459 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ly6dP35459 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ly6dP35459 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ly6dP35459 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ly6dP35459 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ly6dP35459 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ly6dP35459 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ly6dP35459 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ly6dP35459 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ly6dP35459 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ly6dP35459 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ly6dP35459 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ly6dP35459 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ly6dP35459 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ly6dP35459 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ly6dP35459 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ly6dP35459 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ly6dP35459 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ly6dP35459 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ly6dP35459 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ly6dP35459 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms