Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cnga1P29974 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cnga1P29974 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cnga1P29974 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cnga1P29974 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cnga1P29974 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cnga1P29974 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cnga1P29974 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cnga1P29974 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Cnga1P29974 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cnga1P29974 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cnga1P29974 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cnga1P29974 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cnga1P29974 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cnga1P29974 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cnga1P29974 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cnga1P29974 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cnga1P29974 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cnga1P29974 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cnga1P29974 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cnga1P29974 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cnga1P29974 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cnga1P29974 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cnga1P29974 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cnga1P29974 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Cnga1P29974 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cnga1P29974 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Cnga1P29974 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cnga1P29974 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cnga1P29974 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cnga1P29974 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cnga1P29974 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cnga1P29974 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cnga1P29974 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cnga1P29974 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cnga1P29974 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cnga1P29974 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cnga1P29974 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cnga1P29974 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cnga1P29974 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cnga1P29974 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cnga1P29974 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cnga1P29974 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cnga1P29974 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cnga1P29974 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Cnga1P29974 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Cnga1P29974 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cnga1P29974 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cnga1P29974 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cnga1P29974 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cnga1P29974 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cnga1P29974 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cnga1P29974 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cnga1P29974 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cnga1P29974 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cnga1P29974 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cnga1P29974 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cnga1P29974 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cnga1P29974 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cnga1P29974 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Cnga1P29974 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Cnga1P29974 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cnga1P29974 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cnga1P29974 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cnga1P29974 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cnga1P29974 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cnga1P29974 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cnga1P29974 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cnga1P29974 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cnga1P29974 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cnga1P29974 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Cnga1P29974 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cnga1P29974 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cnga1P29974 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cnga1P29974 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Cnga1P29974 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cnga1P29974 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cnga1P29974 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cnga1P29974 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cnga1P29974 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cnga1P29974 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cnga1P29974 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cnga1P29974 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cnga1P29974 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cnga1P29974 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cnga1P29974 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cnga1P29974 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cnga1P29974 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cnga1P29974 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cnga1P29974 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cnga1P29974 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cnga1P29974 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cnga1P29974 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Cnga1P29974 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cnga1P29974 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cnga1P29974 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cnga1P29974 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Cnga1P29974 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cnga1P29974 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cnga1P29974 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms