Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Casp1P29452 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Casp1P29452 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Casp1P29452 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Casp1P29452 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Casp1P29452 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Casp1P29452 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Casp1P29452 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Casp1P29452 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Casp1P29452 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Casp1P29452 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Casp1P29452 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Casp1P29452 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Casp1P29452 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Casp1P29452 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Casp1P29452 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Casp1P29452 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Casp1P29452 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Casp1P29452 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Casp1P29452 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Casp1P29452 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Casp1P29452 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Casp1P29452 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Casp1P29452 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Casp1P29452 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Casp1P29452 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Casp1P29452 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Casp1P29452 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Casp1P29452 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Casp1P29452 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Casp1P29452 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Casp1P29452 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Casp1P29452 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Casp1P29452 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Casp1P29452 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Casp1P29452 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Casp1P29452 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Casp1P29452 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Casp1P29452 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Casp1P29452 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Casp1P29452 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Casp1P29452 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Casp1P29452 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Casp1P29452 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Casp1P29452 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Casp1P29452 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Casp1P29452 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Casp1P29452 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Casp1P29452 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Casp1P29452 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Casp1P29452 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Casp1P29452 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Casp1P29452 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Casp1P29452 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Casp1P29452 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Casp1P29452 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Casp1P29452 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Casp1P29452 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Casp1P29452 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Casp1P29452 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Casp1P29452 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Casp1P29452 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Casp1P29452 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Casp1P29452 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Casp1P29452 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Casp1P29452 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Casp1P29452 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Casp1P29452 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Casp1P29452 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Casp1P29452 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Casp1P29452 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Casp1P29452 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Casp1P29452 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Casp1P29452 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Casp1P29452 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Casp1P29452 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Casp1P29452 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Casp1P29452 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Casp1P29452 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Casp1P29452 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Casp1P29452 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Casp1P29452 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Casp1P29452 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Casp1P29452 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Casp1P29452 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Casp1P29452 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Casp1P29452 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Casp1P29452 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Casp1P29452 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Casp1P29452 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Casp1P29452 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Casp1P29452 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Casp1P29452 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Casp1P29452 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Casp1P29452 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Casp1P29452 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Casp1P29452 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Casp1P29452 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Casp1P29452 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Casp1P29452 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms