Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms