Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtpraP18052 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtpraP18052 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtpraP18052 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtpraP18052 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtpraP18052 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtpraP18052 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtpraP18052 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtpraP18052 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtpraP18052 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtpraP18052 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtpraP18052 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PtpraP18052 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtpraP18052 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtpraP18052 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PtpraP18052 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtpraP18052 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtpraP18052 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtpraP18052 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtpraP18052 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtpraP18052 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtpraP18052 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtpraP18052 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtpraP18052 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtpraP18052 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtpraP18052 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtpraP18052 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtpraP18052 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtpraP18052 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtpraP18052 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtpraP18052 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PtpraP18052 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtpraP18052 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtpraP18052 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PtpraP18052 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtpraP18052 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtpraP18052 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtpraP18052 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtpraP18052 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtpraP18052 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtpraP18052 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtpraP18052 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PtpraP18052 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtpraP18052 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtpraP18052 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PtpraP18052 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtpraP18052 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PtpraP18052 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PtpraP18052 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PtpraP18052 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PtpraP18052 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtpraP18052 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtpraP18052 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtpraP18052 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtpraP18052 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtpraP18052 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PtpraP18052 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtpraP18052 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtpraP18052 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtpraP18052 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtpraP18052 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtpraP18052 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtpraP18052 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtpraP18052 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtpraP18052 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtpraP18052 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PtpraP18052 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtpraP18052 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtpraP18052 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtpraP18052 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtpraP18052 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtpraP18052 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtpraP18052 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtpraP18052 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtpraP18052 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PtpraP18052 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtpraP18052 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtpraP18052 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtpraP18052 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtpraP18052 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtpraP18052 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtpraP18052 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtpraP18052 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtpraP18052 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtpraP18052 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtpraP18052 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PtpraP18052 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtpraP18052 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtpraP18052 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtpraP18052 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtpraP18052 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtpraP18052 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PtpraP18052 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtpraP18052 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtpraP18052 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtpraP18052 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtpraP18052 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtpraP18052 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtpraP18052 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtpraP18052 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms