Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spi1P17433 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spi1P17433 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spi1P17433 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spi1P17433 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spi1P17433 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spi1P17433 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spi1P17433 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms