Protein–RNA interactions for Protein: P08775

Polr2a, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2aP08775 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr2aP08775 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr2aP08775 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr2aP08775 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr2aP08775 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr2aP08775 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr2aP08775 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr2aP08775 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr2aP08775 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr2aP08775 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Polr2aP08775 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Polr2aP08775 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Polr2aP08775 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Polr2aP08775 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Polr2aP08775 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Polr2aP08775 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr2aP08775 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr2aP08775 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr2aP08775 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr2aP08775 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr2aP08775 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr2aP08775 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr2aP08775 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr2aP08775 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr2aP08775 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr2aP08775 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr2aP08775 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr2aP08775 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr2aP08775 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr2aP08775 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr2aP08775 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr2aP08775 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr2aP08775 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr2aP08775 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr2aP08775 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr2aP08775 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr2aP08775 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr2aP08775 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr2aP08775 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr2aP08775 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr2aP08775 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr2aP08775 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr2aP08775 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr2aP08775 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr2aP08775 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr2aP08775 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr2aP08775 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr2aP08775 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Polr2aP08775 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr2aP08775 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr2aP08775 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr2aP08775 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr2aP08775 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr2aP08775 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr2aP08775 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr2aP08775 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr2aP08775 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr2aP08775 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr2aP08775 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr2aP08775 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr2aP08775 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr2aP08775 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr2aP08775 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr2aP08775 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr2aP08775 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr2aP08775 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr2aP08775 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr2aP08775 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr2aP08775 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr2aP08775 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr2aP08775 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr2aP08775 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr2aP08775 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr2aP08775 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr2aP08775 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr2aP08775 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr2aP08775 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms