Protein–RNA interactions for Protein: O88983

Stx8, Syntaxin-8, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx8O88983 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stx8O88983 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stx8O88983 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Stx8O88983 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stx8O88983 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stx8O88983 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stx8O88983 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stx8O88983 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stx8O88983 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stx8O88983 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stx8O88983 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx8O88983 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx8O88983 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx8O88983 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx8O88983 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx8O88983 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx8O88983 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx8O88983 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx8O88983 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx8O88983 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stx8O88983 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stx8O88983 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stx8O88983 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Stx8O88983 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stx8O88983 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stx8O88983 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stx8O88983 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stx8O88983 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stx8O88983 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stx8O88983 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stx8O88983 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stx8O88983 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stx8O88983 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stx8O88983 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stx8O88983 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Stx8O88983 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Stx8O88983 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stx8O88983 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stx8O88983 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stx8O88983 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stx8O88983 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stx8O88983 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stx8O88983 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Stx8O88983 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stx8O88983 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stx8O88983 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stx8O88983 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stx8O88983 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stx8O88983 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stx8O88983 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stx8O88983 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stx8O88983 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stx8O88983 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stx8O88983 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stx8O88983 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stx8O88983 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stx8O88983 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stx8O88983 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stx8O88983 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stx8O88983 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stx8O88983 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stx8O88983 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Stx8O88983 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stx8O88983 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stx8O88983 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stx8O88983 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stx8O88983 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stx8O88983 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stx8O88983 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stx8O88983 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stx8O88983 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stx8O88983 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stx8O88983 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stx8O88983 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stx8O88983 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stx8O88983 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stx8O88983 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stx8O88983 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stx8O88983 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stx8O88983 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Stx8O88983 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stx8O88983 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stx8O88983 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stx8O88983 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stx8O88983 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stx8O88983 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Stx8O88983 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stx8O88983 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stx8O88983 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stx8O88983 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stx8O88983 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stx8O88983 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stx8O88983 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stx8O88983 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stx8O88983 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Stx8O88983 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Stx8O88983 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Stx8O88983 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stx8O88983 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms