Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vamp4O70480 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vamp4O70480 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vamp4O70480 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vamp4O70480 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vamp4O70480 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vamp4O70480 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vamp4O70480 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vamp4O70480 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vamp4O70480 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Vamp4O70480 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vamp4O70480 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vamp4O70480 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vamp4O70480 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vamp4O70480 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vamp4O70480 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vamp4O70480 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vamp4O70480 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vamp4O70480 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vamp4O70480 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vamp4O70480 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vamp4O70480 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vamp4O70480 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vamp4O70480 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vamp4O70480 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vamp4O70480 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vamp4O70480 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vamp4O70480 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vamp4O70480 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vamp4O70480 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vamp4O70480 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vamp4O70480 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vamp4O70480 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vamp4O70480 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vamp4O70480 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vamp4O70480 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vamp4O70480 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vamp4O70480 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vamp4O70480 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vamp4O70480 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vamp4O70480 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vamp4O70480 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vamp4O70480 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vamp4O70480 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vamp4O70480 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vamp4O70480 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vamp4O70480 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Vamp4O70480 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vamp4O70480 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vamp4O70480 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vamp4O70480 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vamp4O70480 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vamp4O70480 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vamp4O70480 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vamp4O70480 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vamp4O70480 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vamp4O70480 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vamp4O70480 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vamp4O70480 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vamp4O70480 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vamp4O70480 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vamp4O70480 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vamp4O70480 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vamp4O70480 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vamp4O70480 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vamp4O70480 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vamp4O70480 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Vamp4O70480 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vamp4O70480 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vamp4O70480 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vamp4O70480 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vamp4O70480 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vamp4O70480 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vamp4O70480 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vamp4O70480 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vamp4O70480 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vamp4O70480 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vamp4O70480 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vamp4O70480 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vamp4O70480 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Vamp4O70480 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vamp4O70480 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vamp4O70480 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vamp4O70480 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vamp4O70480 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vamp4O70480 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vamp4O70480 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vamp4O70480 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vamp4O70480 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vamp4O70480 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vamp4O70480 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vamp4O70480 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vamp4O70480 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vamp4O70480 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vamp4O70480 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vamp4O70480 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vamp4O70480 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vamp4O70480 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vamp4O70480 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vamp4O70480 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.5 ms