Protein–RNA interactions for Protein: O70354

Ca11, Carbonic anhydrase-related protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca11O70354 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ca11O70354 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ca11O70354 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ca11O70354 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ca11O70354 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ca11O70354 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ca11O70354 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ca11O70354 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ca11O70354 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ca11O70354 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ca11O70354 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ca11O70354 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ca11O70354 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ca11O70354 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ca11O70354 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ca11O70354 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ca11O70354 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ca11O70354 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ca11O70354 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ca11O70354 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms