Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BckdkO55028 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BckdkO55028 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BckdkO55028 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BckdkO55028 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BckdkO55028 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BckdkO55028 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BckdkO55028 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BckdkO55028 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BckdkO55028 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BckdkO55028 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BckdkO55028 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BckdkO55028 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BckdkO55028 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BckdkO55028 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BckdkO55028 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BckdkO55028 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BckdkO55028 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BckdkO55028 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BckdkO55028 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BckdkO55028 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BckdkO55028 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BckdkO55028 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BckdkO55028 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
BckdkO55028 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BckdkO55028 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BckdkO55028 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BckdkO55028 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BckdkO55028 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
BckdkO55028 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BckdkO55028 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BckdkO55028 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BckdkO55028 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BckdkO55028 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BckdkO55028 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BckdkO55028 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BckdkO55028 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BckdkO55028 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BckdkO55028 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.2 ms